W przeciwieństwie do skomplikowanych fungicydów oraz insektycydów, ozon ulega biodegradacji do czystego tlenu, nie pozostawiając po sobie toksycznych półproduktów rozpadu. Nie odkłada się w tkankach organizmów żywych, nie skaża gleby ani wody.

Należy podkreślić, że ozon nie jest trucizną fizjologiczną, a bardzo gwałtownym utleniaczem, zatem działa niszcząco nie tylko na żywe mikroorganizmy, ale również na wirusy ( w przeciwieństwie do innych aseptyków, lub antybiotyków ). Ponadto ozon usuwa poprzez utlenianie z powietrza opary substancji organicznych, takich jak rozpuszczalniki, benzyny, laki, farby, oleje naturalne oraz syntetyczne i wiele innych.

Ozon jest całkowicie bezpieczny dla środowiska, przy odpowiedniej metodzie wytwarzania, oraz dezaktywacji. Ekonomiczność generatorów ozonu wynika również stąd, że nie potrzebują żadnych zbiorników, które trzeba by było uzupełniać podczas eksploatacji, ponieważ produkują one ozon z tlenu zawartego w powietrzu, co za tym idzie, wystarczy jedynie podłączenie do prądu sieciowego, żaden z elementów urządzenia nie zużywa się podczas eksploatacji.